Tugas resuman
PSDH

Nama : pitriana
NIM :J1C108042
Prodi : biologi

- Apa dan bagaimana pengertian dari Keanekaragaman hayati

Biodeversity atau yang kita kenal bersama dengan keanekaragaman hayati biasanya dianggap pada tiga tingkatan: spesies, keragaman genetik, dan ekosistem. Kategori pertama mengacu pada keragaman dan kelimpahan spesies di wilayah geografis, jumlah spesies yang paling sederhana dan paling umum digunakan keanekaragaman hayati.

Meskipun kecenderungan untuk fokus pada spesies, dengan mengandalkan spesies dan jumlah mereka pada masing-masing, pesies terdiri dari subspesies, populasi, dan individu. Bahkan, banyak keputusan konservasi praktis sasaran subspesies dan populasi daripada spesies.
Kepunahan spesies adalah contoh paling konkret hilangnya keanekaragaman hayati. Oleh harena itu, suatu spesies menjadi punah bila anggota terakhir meninggal. Hanya beberapa individu dari suatu spesies yang ada, bahwa spesies bisa menjadi punah secara fungsional, yang berarti bahwa reproduksi dan panjang kelangsungan hidup spesies itu menjadi mustahil. Sebuah spesies menjadi punah di alam liar saat satu-satunya individu hidup yang mana spesies dipelihara dalam lingkungan yang tidak alami, seperti kebun binatang.
Teori ekologi menunjukkan bahwa beberapa faktor yang berkontribusi pada kerentanan spesies tertentu merupakan kepunahan. Spesies yang paling rentan terhadap kepunahan meliputi organisme besar, spesies tinggi, spesies dengan rentang populasi kecil atau populasi ukuran, spesies yang telah berevolusi dalam isolasi, spesies dengan sedikit pengalaman, spesies dengan penyebaran miskin atau penjajahan kemampuan, migrasi spesies, dan spesies bersarang atau mereproduksi dalam koloni. Banyak pulau dan spesies endemik lokal yang terbagi dalam beberapa karakteristik di atas.
Secara keseluruhan, Kepulauan Hawaii adalah sarang ambigu dari kepunahan, meskipun mereka telah tercatat di setiap negara bagian AS. Hanya terdiri dari Hawaii sebagian kecil (kurang dari 0,2 persen) dari total luasan lahan di Amerika Serikat, tetapi menyumbang sekitar 30 persen dari kepunahan dan 50 persen dari kemungkinan kepunahan.

- Faktor Manusia

Penyebab utama penurunan keanekaragaman hayati kontemporer habitat perusakan dan degradasi, didorong oleh ekspansi manusia populasi dan kegiatan. Hilangnya habitat adalah penyebab utama yang membahayakan untuk 85 persen dari spesies terdaftar di bawah Endangered Species Act (ESA), undang-undang federal utama yang mengatur proteksi dan pengelolaan keanekaragaman hayati. Invasif spesies penyebab kepunahan kedua spesies .
Pendahuluan dapat melalui impor tanaman hias, peternakan, dan permainan spesies atau tidak sengaja, diperkenalkan melalui air pemberat, pot tanah, atau pengangkutan kontainer. Tol dari berbagai kondisi lingkungan, tingginya tingkat reproduksi dan penyebaran, dan kurangnya predator alami dalam komunitas baru adalah ciri-ciri yang membantu spesies nonnative berkembang di habitat baru.
terutama bila dikombinasikan dengan fragmentasi, penurunan konektivitas habitat, dan menekankan bahwa siap mengancam banyak spesies dan dapat menciptakan hambatan tambahan penyesuaian terhadap perubahan kondisi. Contoh yang paling terkenal dari spesies seperti beruang kutub, yang baru-baru ini ditambahkan ke daftar spesies, dan secara serius terancam oleh perkiraan perubahan es laut yang terkait dengan perubahan iklim.

- Mengintegrasikan Ekonomi dan Ekologi untuk Bantuan Pertahankan Keanekaragaman Hayati

Hal yang penting dalam menentukan waktu jangka panjang sesuai keanekaragaman hayati yaitu dengan kebijakannya adalah bahwa ekonomi dan ekologi yang tidak dapat dihindari. Berhasil mengidentifikasi strategi untuk melestarikan keanekaragaman hayati memerlukan tegrating ekonomi dan ekologi.
Karena sebagian besar keanekaragaman hayati menempati cadangan, memeriksa alternatif strategi manajemen untuk daerah yang menggunakan secara terpusat penting. Memahami perubahan pemanfaatan lahan, serta sebagai pemilik tanah referensi dan perilaku relatif terhadap alternatif kebijakan konservasi keanekaragaman hayati, adalah membantu dalam menemukan pendekatan praktis untuk melindungi keanekaragaman hayati.

TUGAS PSDH

Tugas Resuman
PSDH

Nama : Pitriana
NIM : J1C108042
Prodi : biologi

“Glycine N-methyltransferase Merupakan Contoh dari Fungsional Diversity Yang
Berperan Sebagai Polycyclic Hidrokarbon Aromatik Yang Mengikat Reseptor”

Gen sitokrom dapat diatur oleh beberapa faktor termasuk Polycyclic Aromatik Hidrokarbon (PAH) dari protein, ini diidentifikasikan sebagai N-methyltransferase glisin (GNMT). Peran GNMT sebagai PAH yaitu dapat mengikat protein dan menginduksi sitokrom yang telah diselidiki lebih lanjut. GNMT cDNA melakukan proses kloning ke dalam vektor pMAMneo yang berisi Rous sarcoma virus promotor dan gen resistensi neomisin, yang secara stabil mentarnfer ke indung sel telur hamster.

Polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) seperti 3 methylcholanthrene dan TCDD adalah polusi lingkungan yang mendatangkan berbagai beracun, teratogenik, dan karsinogenik terhadap hewan. Selain itu, bahan ini sangat ampuh reaksi tertentu yang dikatalisis oleh sitokrom P-450 yang tergantung pada monooxygenases, yang terdiri dari isozymic hemoproteins lebih dari 12 kelompok gen. Isozymes ini merupakan substrat kekhususan dan memetabolisme substrat endogen baik untuk elektrofilik derivative. Beberapa di antaranya dapat berinteraksi dengan DNA, sehingga berpotensi mengaktifkan protokogenes atau menonaktifkan gen supresor tumor.
GNMT pertama kali ditemukan dalam ekstrak hati dan terlibat dalam oksidasi metil karbon dari metionin, meskipun jalur ini account hanya 20% dari total metil metabolisme metionin. Kemudian, Kerr (35) menyatakan bahwa enzim berperan dalam pengturan tingkat relatif S-adenosylmethionine dan S-adenosylhomocysteine dalam sel. Dalam sebuah studi berikutnya Cook danWagner (41), menerangkan bahwa GNMT ditunjukkan bertindak sebagai protein folat dalam sitosol dari hati tikus. Tikus GNMT, dalam enzimatik yang berperan adalah homotetramer terdiri dari 33-kDa subunit, yang tersedia situs mengikat independen untuk S-adenosylmethionine, glisin, dan folat.
Bentuk enzimatik GNMT, yaitu homotetramer, tidak aktif sebagai binding protein, dan monomer tidak dapat berfungsi baik enzimatik atau sebagai pengikat. Bukti permulaan menunjukkan homodimer sebagai fungsional mengikat 2 unit CDNA untuk GNMT yang telah terisolasi.

- BAHAN DAN METODE

Medium kimia dari kultur jaringan, yang merupakan minimal medium penting, serum janin sapi, gentamycin, geneticin (G418), dan Lipofektin itu dari teknologi, sumber bahan lain adalah: [a-32P] dATP dari ICN biokimia (Irvine, CA), (60 Ci / mmol) dari Amersham Corp, [3H] TCDD (41 Ci / mmol) dari Chem-Syn Science Labs (Lenexa, KS), Immobilon P dari Millipore (Bedford, MA), S & S mentransfer membran dari Schleicher & Schuell (Keene, NH), BM Chemiluminescence blotting Barat kit dari Biochemica Boehringer Mannheim Corp (Indianapolis, IN), Tris, TEMED, Tween 20, 3-methylcholanthrene, TCDD, Isositrat dehidrogenase, nikotinamida, ethoxyresorufin, dan resorufin dari Sigma.
Afinitas dimurnikan dengan antibodi terhadap Ah GNMT dan reseptor itu dari Dr Conrad Wagner (Vanderbilt University) dan Dr Bill Greenlee (University of Massachusetts Medical Center), masing-masing. Ah reseptor yang mengandung plasmid cDNA itu baik disediakan oleh Dr Chris Bradfield (University of Wisconsin).
MK onstruksi plasmid dan transfection, GNMT cDNA ini disintesis dengan RT-PCR metodologi dari hati tikus poli (A) 1 RNA persiapan. GNMT spesifik yang maju dan bersifat primer strukturnya adalah 59-GAGCCAGCTAGCGTCAGGATGGTGGAC dan 59-TGGGAGCTCGAGCCAGGCTCAGCCTGT, masing-masing produk berikutnya dimurnikan dengan gel agarosa electophoresis, dan urutan ini ditunjukkan dengan GNMT cDNA. Dua situs kloning untuk NheI dan XhoI dimasukkan ke dalam daerah noncoding dari GNMT cDNA oleh metodologi PCR. Yang disucikan DNA beruntai ganda Produk ini diligasi ke NheI / XhoI kemudian dicerna pMAMneo (CLONTECH, Palo Alto, CA). Plasmid bersifat membangun, pMAMneo / GNMT, yang berisi GNMT dimasukkan dari ukuran yang sesuai dalam arti orientasi yang ditentukan oleh urutan pembatasan pencernaan. pMAMneo / GNMT mentransfer CHO ke sel oleh Lipofectin metode.
Sitoplasma dapat dipisahkan dengan sentrifugasi 10.000 3 g pada suhu 4°C. Total selular protein yang telah ditambahkan pada SDS-8% Polyacrylamide gel elektroforesis, dan protein dipindahkan ke Immobilon P membran yang menggunakan Bio-Rad. Selaput didiamkan selama 1 jam dalam kondisi 5% kering tanpa lemak susu dalam Tris-garam, pH 7.5, dan diinkubasi semalam dengan antibodi primer yang tepat, diikuti dengan inkubasi selama 1 jam dengan antibodi sekunder terkait dengan peroksidase.
Total RNA sampel (40 mg) yang didenaturasi dengan pemanasan pada suhu 65°C selama 15 menit di 50% (v / v) formamide, 2.2 M formaldehida, 0,53 buffer dan fraksi melalui elektroforesis dengan gel yang mengandung formalin 1,5% agarosa. Sampel RNA ditransfer untuk Nytran selaput (Schleicher & Schuell) di 10 SSPE, prehybridized, dan hibridisasi dengan menggunakan berbagai DNA yang berlabel untuk aktivitas tertentu ,108 cpm / mg DNA dengan dATP menggunakan metode primer acak.
Secara singkat, sel-sel dihentikan dalam 10 mM HEPES, pH 7.5, selama 15 menit, sentrifugal, resuspen dalam 1 sel volume pelet tidur (25 HEPES mM, pH 7,5, 2 mM EDTA, 1 mM dithiothreitol) dan gangguan di Dounce Homogenizer. Setelah sentrifugasi dalam proses pendinginan 10 menit pada 14.000 g, pelet nuklir itu resuspen dalam 1 sel pelet volume ranjang, 0.4 M KCl pada 4°C selama 30 menit. Setelah homogenisasi dalam Dounce ketat aparat, gliserol ini ditambahkan dengan konsentrasi akhir 20% (v / v). Fraction nuklir diperoleh oleh sentrifugasi pada 180.000 g selama 30 menit pada 4°C, dan 32P-label yang beruntai ganda oligonukleotida sintetik, yang berisi XRE1 21.003-2.977 pasangan basa dari CYP1A1 sel tikus.

- HASIL

Sel CHO dipilih sebagai target untuk transformasi karena kurangnya ekspresi gen endogen dan efisiensi GNMT transfection dengan pMAMneo / GNMT menggunakan Lipofectin teknik. 35 neomisin-klon resisten secara acak dipilih, terisolasi, dan tumbuh menjadi budaya massa untuk karakterisasi lebih lanjut. Penyaringan awal dilakukan oleh RT-PCR analisis dari klon G418. Hanya CHO-GNMT sel (di samping hati RNA) ditunjukkan yang benar 4 S transkip.
Analisis RT-PCR dan b-aktin transkrip dari Sel CHO. Total selular RNA (0,5 mg) telah ditaklukkan kepada RT-PCR analisis selama 35 siklus dalam total volume 50 ml. 10 ml sampel reaksi dari CHO, CHO-neo dan CHOGNMT sel ini dielektroforesis pada 1,5% gel agarosa.
RNA yang telah ditransfer untuk nitroselulosa membran ini secara bersamaan diselidiki dengan CYP1A1 dan b-aktin cDNA. Hanya 3-methylcholanthrene yang dapat menimbulkan CYP1A1 positif mRNA. TCDD mewakili prototypic ligan untuk reseptor Ah, itu tidak efektif dalam mendorong CYP1A1 di GNMT CHO sel, b-Napthoflavone juga tidak efektif dalam mendorong CYP1A1 dalam sel-sel ini. Ekspresi CYP1A1 Protein dan EROD diinduksi, CHO-neo, dan GNMT CHO sel dan dianalisis pada gel SDS untuk CYP1A1 protein..
Ah reseptor pada aktivitas GMSA untuk XRE1 adalah dicirikan dengan protein yang berpartisipasi dalam dioxin-dimediasi induksi CYP1A1 dengan cara mengikat XREs terkait dengan CYP1A1.Pembentukan reseptor XRE Ah rumit dibuktikan dengan ekstrak nuklir yang dibuat dari HEPA-1 sel yang telah diperlakukan dengan TCDD.

- DISKUSI

PAH 4 S protein diidentifikasi sebagai GNMT pada dasarnya dari beberapa kriteria, termasuk pemurnian, pengurutan, immunoprecipitation dari PAH aktivitas mengikat antibodi poliklonal untuk GNMT, dan copurification dari dua protein dalam
berbagai sel dan jaringan.
Penelitian ini dirancang untuk memperkenalkan GNMT gen ke dalam sel yang tidak memiliki kemampuan untuk mengekspresikan protein serta reseptor Ah. Sel-sel ini kemudian akan menyediakan model biologis yang cocok untuk menguji induksi oleh PAHs seperti 3-methylcholanthrene. Hasil studi ini memberikan informasi langsung peran fungsional sebagai GNMT PAH protein yang dapat menengahi induksi CYP1A1. .
Fosforilasi yang terlibat dalam menstabilkan PAH mengikat bentuk (dimer) dari protein. Akibatnya, tingkat itu membatasi faktor dalam menentukan jumlah transkripsional fungsional penggerak yaitu keadaan fosforilasi dalam bentuk dimer GNMT dan konsentrasi intraselular PAH. Jumlah homotetramer, yaitu bentuk utama GNMT yang relevan.

Kawasan Pesisir Pantai Tabanio dan Damit

A. Kawasan Tabanio

Gambar 1.pesisir pantai Tabanio

Lahan basah yang terdapat didaerah pesisir adalah salah satu tipe lahan basah yang potensial untuk dikembangkan, namun demikian, dalam pengembangannya harus mempertimbangkan efek global dan lingkungan sekitarnya. Melalui pengamatan yang telah kami lakukan yaitu pada suatu kawasan lahan basah pesisir pantai yang terdapat didesa Tabanio.

Tabanio atau yang lebih dikenal dengan sebutan pagatan besar adalah salah satu nama desa yang terlatak disekitar pesisir pantai yang ada di Kalimantan selatan, masyarakat didesa ini sebagian besar adalah petani dan sebagai lagi merupakan nelayan yang mengantungkan hidupnya pada laut.

Gambar 2, kawasan pantai Tabanio

Fakta yang kami temukan dilapangan membuktikan bahwa kawasan pesisir pantai tabanio bukan hanya sekedar tempat masyarakat beraktifitas tapi juga merupakan tempat berbagai organisme yang hidup didalamnya. Masalah yang saya bahas disini adalah mengenai abrasi pantai yang terjadi didesa tabanio.

Abrasi dapat dikatakan sebagai proses pengikisan pantai oleh tenaga gelombang laut dan arus laut yang bersifat merusak, abrasi biasanya disebut juga erosi pantai. Kerusakan garis pantai akibat abrasi ini dipacu oleh terganggunya keseimbangan alam daerah pantai tersebut, walaupun abrasi bisa disebabkan oleh gejala alami, namun manusia sering disebut sebagai penyebab utama abrasi.

Jika kondisi ini tidak diantisipasi, laju abrasi pantai yang sangat tinggi tersebut sudah pasti mengancam berbagai infrastruktur, kawasan permukiman, sarana dan prasarana publik, bahkan yang paling serius adalah kemungkinan besar akan tengelamnya kawasan tersebut.

Seperti yang kita ketahui bersama tiap detik gelombang datang menghantam pantai dan tiap detik pula menggerus daratan. Tanah dan pasir terseret ke laut dan hilang bercampur dengan butir pasir laut, kibatnya daratan menjadi hilang seperti yang terjadi pada pulau Nipah di Kepulauan Riau harus menjadi pelajaran berharga. Sebab, eksploitasi alam yang tak terkendali berupa penambangan pasir berdampak serius terhadap keberadaan pulau tersebut.

Penyebab terjadinya abrasi pantai kemungkinan adalah karena :

1. Eksploitasi alam berupa penambangan pasir di sepanjang pesisir pantai secara sembarangan,

2. Rusaknya ekosistem hutan mangrove di pesisir pantai,

3. Pembuangan sampah dan dan limbah ke daerah bantaran sungai dan pesisir pantai,

4. pembuatan tambak-tambak yang tidak sesuai dengan ketentuan yang berlaku, faktor alam dan lain-lain

Untuk mengatasi Laju abrasi yang menghantam kawasan pantai Indonesia khususnya untuk daerah pantai tabanio ini langkah yang dapat kita lakukan adalah dengan diantisipasi dengan langkah terpadu dan terkoordinasi oleh semua pihak, salah satu contohnya dengan melakukan usaha-usaha seperti:

1. Penanaman, pelestarian dan merestorasi kawasan hutan mangrove disepanjang kawasan pesisir

2. Tidak melakukan eksploitasi pasir laut secara serampangan

3. Tidak membuang limbah-limbah yang dapat merusak struktur tanah dan vegetasi alam ke sepanjang Daerah Aliran Sugai (DAS) dan wilayah pesisir pantai

4. Membuat tanggul disepanjang wilayah pesisir untuk menanggulangi ancaman abrasi.

5. Menyiapkan regulasi penanganan abrasi yang konsisten dan berkesinambungan, dari berbagai elemen terkait, termasuk masyarakat dan lain-lain.

B. Kawasan Damit

Gambar 3, kawasan Damit

Damit adalah nama sebuah Desa yang terletak disalah satu rangkaian pegunungan , daerah ini terletak didaratan tinggi yang seluruhnya dikelilinggi oleh hutan- hutan kecil dan padang ilalang. Damit merupakan salah satu daerah tangkapan air, yang dijadikan bendungan, dibendungan inilah beberapa anak sungai kecil dan air hujan ditampung kemudian dijadikan sebagai keperluan pertanian dan perkebunan. Fakta yang kami temukan dilapangan membuktikan bahwa kawasan tangkapan air ini merupakan kawasan yang sangat penting bagi beberapa organisme maupun bagi penduduk disekitarnya.

Gambar 4, saluran irigasi

Selain sebagai daerah tangkapan air kawasan ini juga sebagai tembat habitat berbagai flora dan fauna, kegiatan masyarakat didearah ini selain sebagai petani juga masyakakat sekitar membudidayakan ikan – ikan, berkebun dan aktifitas lainnya.

Melalui hasil obsenvasi yang kami lakukan pada kawasan Damit ini, merupakan suatu kawasan pertanian dan perkebunan penduduk sekitar, sebagian besar perkebunan masyakakat berada pada lereng gunung dan jauh dari perairan, jadi masyarakat mengairi persawahan dan perkebunanya dengan sumber irigasi yang terdapat dikawasan tersebut, dari sumber irigasi yang besar disalurkan melalui selang – selang besar dan parit untuk sampai pada lokasi persawahan maupun perkebunan disekitarya.

Mengingat pentingnya sumber irigasi dikawasan ini, maka ini adalah menjadi tanggung jawab kita bersama untuk menjaga dan memeliharanya khususnya bagi penduduk sekitar yaitu mengolah kawasan ini dengan sebaik- baiknya.

Oleh :

Nama : Pitriana

NIM : J1C108042

Prodi : Biologi.

weatland

PENGENALAN LINGKUNGAN LAHAN BASAH

Indonesia merupakan salah satu negara yang mempunyai lahan basah yang didukung oleh keanekaragaman lahan basah yang luas, luas lahan basah diindonesia adalah mencapai 38 juta ha.

Wetland mempunyai beberapa ciri yang tampak, dan yang paling jelas adalah adanya air yang tetap, tanah wetland yang unik dan ditumbuhi oleh vegetasi yang mampu beradaptasi atau toleran terhadap tanah yang jenuh air. Wetland tidak mudah untuk didefinisikan, namun secara khusus untuk tujuan yang formal karena memiliki selang kondisi hidrologi yang dapat dipertimbangkan, karena wetland berada pada antara lahan kering dan sistem air dalam, dan karena memiliki variasi yang besar dalam ukuran, luasan, dan pengaruh manusia.

Berdasarkan hasil survey yang telah dilakukan yaitu dengan mengkaji kondisi lahan basah di desa sungai sipai, martapura, provinsi kalimantan selatan, maka dapat dideskripsikan bahwa lahan basah ini terletak dikawasan sekitar pemukiman penduduk, kawasan ini sangat luas dan dapat dikatakan sebagai suatu kawasan yang secara alami digenagi oleh air yang tenang atau yang biasa disebut dengan tungkaran, dan Air yang mengenangi lahan basah ini adalah air tawar. dan tidak menutup kemungkinan bila terjadi musim kemarau lahan basah ini akan menjadi kering.

Sedangkan komuditas tanaman yang ada pada lahan basah ini melipiuti eceng gondok, teratai, purun tikus, maupun tanaman yang menyerupai lumut. dan untuk komuditas hewan yang berada pada ekosistem lahan basah ini misalnya, ikan lele, gabus, belut, ikan sepat maupun siput, dan spesies burung juga dijumpai di kawasan ini.

Nama : Pitriana
NIM : J1C1O8042
Prodi : Biologi